Banyak pemimpin politik Pakistan menghadapi tuduhan pengkhianatan, tetapi ini adalah pertama kalinya seorang mantan kepala negara dihukum berdasarkan Pasal 6 Konstitusi.
Kasus ini telah berlarut-larut selama lebih dari lima tahun dengan bangku berubah beberapa kali.
Musharraf didakwa pada 2014 karena memberlakukan keadaan darurat pada 3 November 2007.
Ada kekhawatiran kuat bahwa persidangan tidak akan pernah mencapai kesimpulannya karena perlawanan yang dilaporkan dari militer.
Meskipun dipanggil berulang kali, Musharraf gagal muncul di pengadilan. Dia telah berada di luar negeri selama beberapa tahun terakhir dan dirawat di rumah sakit karena masalah kesehatan yang serius. Dia meninggalkan negara itu pada Maret 2016.
Pengadilan menyatakan dia melarikan diri.
Jelas bahwa pemerintah PTI tidak tertarik untuk mengejar kasus makar.
Dalam sebuah langkah dramatis bulan lalu, ia menarik tim jaksa penuntutnya dan meminta pengadilan untuk menghentikan persidangan, dengan mengatakan kasus terhadap mantan pemimpin militer itu lemah.
Putusan pengadilan telah memperburuk kesulitan pemerintah.
Masih harus dilihat apakah itu menantang keyakinan Musharraf di Mahkamah Agung.
Musharraf diharuskan hadir di negara itu untuk mengajukan banding atas hukumannya tetapi kepulangannya tidak mungkin.
Jenderal Musharraf mengambil alih kekuasaan pada 12 Oktober 1999, dalam sebuah kudeta yang menggulingkan pemerintahan Perdana Menteri Nawaz Sharif.
Dia mengundurkan diri sebagai presiden pada Agustus 2008 di bawah ancaman pemakzulan oleh pemerintah sipil terpilih yang dipasang setelah pemilihan umum tahun itu.
Menariknya, kasus pengkhianatan diajukan lebih dari lima tahun setelah keluarnya Musharraf yang dilaporkan terjadi setelah kesepakatan yang ditengahi oleh AS yang menjamin ganti rugi kepada mantan presiden.
Dalam kabel yang dikirim ke Washington dan dibocorkan oleh WikiLeaks, duta besar Amerika saat itu Anne Patterson melaporkan bahwa Asif Zardari telah mengatakan kepadanya bahwa dia berkomitmen untuk memberikan ganti rugi kepada Musharraf.
Duta Besar menekankan bahwa hanya janji ganti rugi yang telah membujuk Musharraf untuk mundur sebagai presiden.
Pemerintah PPP yang berkuasa setelah pemilu 2008 mengambil sumpah dari Musharraf yang masih menjadi presiden.
Tetapi situasi berubah setelah kembalinya kekuasaan Nawaz Sharif sebagai perdana menteri.
Baginya, itu tampaknya menjadi kesempatan untuk menyelesaikan skor dengan seorang pria yang tidak hanya menggulingkannya tetapi juga mengadilinya karena penghasutan.
Tentu saja ada aspek balas dendam terhadap keputusan untuk memulai persidangan makar, meskipun pemerintah menyatakan bahwa itu hanya mematuhi putusan Mahkamah Agung.
Menariknya, mantan penguasa militer itu diadili bukan karena ‘dosa asal’ melakukan kudeta terhadap pemerintah terpilih, tetapi karena memaksakan keadaan darurat dan menahan Konstitusi pada tahun 2007.
Argumen utama untuk tidak menuntut Musharraf atas kudeta adalah bahwa Mahkamah Agung dan parlemen mengganti rugi tindakannya.
Banyak ahli hukum mempertanyakan apakah tindakan 2007 saja memberikan alasan yang cukup untuk keyakinannya berdasarkan Pasal 6, mengabaikan pengambilalihan asli.
Menghadapi protes massa terhadap pemerintahnya, Musharraf pada 3 November menangguhkan Konstitusi dan mengumumkan keadaan darurat dalam apa yang oleh para analis disebut kudeta kedua.
Sebagian besar hakim pengadilan tinggi, termasuk hakim agung, ditahan. Tindakan itu juga mengakhiri sembilan tahun pemerintahannya.
Musharraf juga terlibat dalam kasus-kasus lain termasuk operasi Masjid Lal. Pengadilan telah memerintahkan penyitaan semua propertinya dan membekukan rekening banknya.
Rupanya, kepemimpinan militer telah menjauhkan diri dari persidangan Musharraf, tetapi itu tidak benar-benar terjadi.
Mengomentari pengadilan pengkhianatan tingkat tinggi Musharraf pada tahun 2015, panglima militer saat itu Jenderal Raheel Sharif menyatakan bahwa tentara akan “menjaga martabat dan kebanggaan institusionalnya sendiri”.
Jelas bahwa Musharraf telah dilindungi oleh militer dan tidak akan menerima keyakinannya atau apa yang digambarkan sebagai “penghinaan terhadap institusi”.
Secara signifikan, putusan Musharraf datang sehari setelah Mahkamah Agung merilis putusan penuh dalam kasus perpanjangan panglima militer Jenderal Qamar Bajwa.
Pengadilan telah mengizinkan panglima militer untuk tetap menjabat selama enam bulan sambil menunggu pengaturan perpanjangan jabatannya melalui undang-undang parlemen.
Itu membuat situasinya tidak pasti.
Keputusan itu telah meninggalkan banyak pertanyaan yang belum terjawab.
Ini telah memicu perdebatan baru apakah itu memerlukan amandemen konstitusi atau hanya perubahan aturan.
Keputusan itu telah memperdalam kontroversi mengenai perpanjangan panglima militer.
Kedua perintah pengadilan menunjukkan penegasan otoritas yang belum pernah terjadi sebelumnya oleh peradilan superior negara itu.
Hal itu telah menyebabkan konflik baru antara militer dan peradilan yang pada gilirannya dapat memperburuk krisis politik.
Ini belum akhir dari permainan.
Apa yang terjadi selanjutnya akan menjadi ujian serius bagi pemerintah dan juga sistem.
Penulis adalah seorang jurnalis. Dawn adalah anggota mitra media The Straits Times, Asia News Network, aliansi 24 judul media berita.